內(nèi)蒙古自治區(qū)科學技術協(xié)會（簡稱：內(nèi)蒙古科協(xié)）代表大會和它選舉產(chǎn)生的全區(qū)委員會是內(nèi)蒙古科協(xié)全區(qū)領導機構。內(nèi)蒙古科協(xié)全區(qū)代表大會常務委員會是內(nèi)蒙古科協(xié)全區(qū)代表大會的常設機構。內(nèi)蒙古科協(xié)代表大會每五年舉行一次，由內(nèi)蒙古科協(xié)委員會召集。特殊情況下，可以提前或延期舉行。內(nèi)蒙古科協(xié)代表大會的代表名額和選舉辦法由常務委員會決定，其代表經(jīng)全區(qū)學會和盟、市科學技術協(xié)會及有關方面民主協(xié)商，選舉產(chǎn)生。內(nèi)蒙古科協(xié)代表大會代表實行任期制。

內(nèi)蒙古科協(xié)代表大會行使下列職權：

一、決定內(nèi)蒙古科協(xié)的工作方針和任務;

二、審議和批準內(nèi)蒙古科協(xié)委員會的工作報告;

三、選舉產(chǎn)生全區(qū)委員會;

四、決定其他重大事項。

內(nèi)蒙古科協(xié)代表大會現(xiàn)有代表508名。